Joaquim Mendes do Amaral era filho de Modesto Mendes do Amaral, este casado em 1831 no Amparo com Joana Maria de Jesus, bragantina, filha de Feliciano Pedroso de Moraes e Maria Joaquina. Esse casal em 1838 era proprietário de um imóvel na Rua do Meio, atual Rua Duque de Caxias. Modesto, por sua vez, era filho de Lino de Oliveira Cardoso, este filho de João de Siqueira Alvarenga e de Maria Cardoso de Oliveira. Lino de Oliveira Cardoso foi um dos patriarcas do antigo Amparo, um de seus mais antigos e respeitados moradores. (SL, 1:112 e 5:346)
Joaquim Mendes do Amaral casou em 1850 no Amparo com Ana Franco da Conceição, filha de Generoso Domingues Cardoso e Maria Gertrudes de Jesus. Joaquim em 1873 era proprietário de uma fazenda de café no município de Amparo. (Almanak da Província de São Paulo de 1873, 421)
Em 6/6/1875 Joaquim Mendes do Amaral e sua mulher Maria Ana Franco da Conceição fizeram sociedade com Felipe Corrêa Macedo Pacheco para exploração agrícola (1ºof., 33:54v). Em 1876 o casal tinha prédios na Rua Direita. (Atas,3:295)
Foi eleito vereador em 1887 para o quatriênio que terminaria em 1891, mas que não chegou ao seu término devido à proclamação da República. Antes disso, porém, em 7/1/1888, na eleição para vice-presidente da Câmara, Joaquim Mendes do Amaral obteve 4 votos, contra 3 de Joaquim Inácio da Silveira, e 1 de Salvador José de Miranda. (Atas, 6:52) Em 1889 não conseguiu repetir o sucesso, sendo derrotado, em 7/1/1889, por Joaquim Bernardino de Arruda, que foi eleito vice-presidente da Câmaras com 3 votos, vencendo a Joaquim Mendes do Amaral, com 2 votos; ao Barão do Socorro, com 1 voto; e a Salvador José de Miranda, que teve 1 voto. (Atas, 6:234)